Рассматривается специфика инженерии знаний при обеспечении интероперабельности действующих и модернизируемых АСУ и информационных систем. Показывается, что интероперабельность может быть достигнута за счет обеспечения декларативного характера проектирования, основанного на применении концептуального подхода к моделированию и онтологическому описанию стадий жизненного цикла. Декларативное проектирование может быть описано в рамках логико-лингвистической модели, при этом экспертами разрабатываются графы знаний, на базе которых составляются частные онтологии различных стадий жизненного цикла.